MATE-Laboratóriumi szolgáltatások DBR-2025/II.név

Description du marché

Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Molekuláris és biotechnológiai eljárások” szolgáltatási kategóriában, különféle szekvenálások tárgyában vállalkozási szerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. 1. A beszerzés tárgya: Baromfi béltartalom 16S rDNS alapú mikrobiális genom szekvenálás Vizsgálandó minták száma: 100 db egyedi minta és 36 db poolozott minta (72 egyedi mintából), összesen 136 db minta 2. Elvárt minimum követelmények: • A bakteriális DNS kivonása, majd további tisztítás a gyártó protokollja szerint. • Genomiális DNS koncentrációjának mérése és szükség esetén poolozása • A poolozott minták bakteriális genomi DNS amplifikálása, amely legalább a bakteriális 16S rDNS gén V3 – V4 régióját fedje le • 16S riboszómális RNS (16 S rDNS) gén alapú új generációs szekvenálás (NGS) • A PCR könyvtárak minőségi és mennyiségi meghatározása (Quality Control – QC) • A könyvtárak ekvimoláris szekvenálása Illumina MiSeq vagy azzal egyenértékű platformon, 300 bázispár olvasási hosszúságú párosított protokoll használatával. • A további bioinformatikai feldolgozásra is alkalmas nyers és bioinformaikailag előszűrt szekvenált adatok (FastQ fájlok), interaktív Krona ábrák és excel fájlok (Individual és Aggregate Summary) elküldése. A minták gyűjtése, ill. a minták biztosítása a megrendelő feladata. Eredménytermék: Laboratóriumi dokumentáció (vizsgálati eredményeket tartalmazó vizsgálati jegyzőkönyv) megküldése elektronikus formában (pl. fizikai adathordozó, e-mail csatolmány, felhőben való elhelyezés). A teljesítés során elvárt: Vállalkozó, a részére átadott mintákból genomi DNS izolálást és PCR inhibítor eltávolítást végez. Az izolált genomi DNS minták kvantitálása után, a koncentrációk alapján Vállalkozó a párhuzamos mintákat poolozza. Vállalkozó a kapott eredményeket (koncentrációk) tartalmazó mérési jegyzőkönyveket, riportokat a Megrendelő rendelkezésére bocsájtja. A 16 S riboszómális DNS (16 S rDNS) gén alapú új generációs szekvenálása (NGS). A szekvenálási eredmények elküldése olyan formában, amely további bioinformatikai feldolgozásra alkalmas Nyertes ajánlattevő konzultációra köteles lehetőséget biztosítani a megrendelés és a teljesítés minden fázisában. 3. Teljesítés határideje: A minták átadására a szerződés hatálya alatt 1 alkalommal kerül sor. A mintaátadásra a szerződéskötést követő 10 naptári napon belül, a felek által előzetesen egyeztetett időpontban kerül sor. A teljesítési határidő a minták átadásától számított 42 naptári nap. Ajánlatkérő előteljesítést elfogad.

Pouvoir adjudicateur

Contexte et conseils