Rahmenvertrag zur Sequenzierungsleistungen nach "Next-Generation"-Sequenzierung (Los 1) sowie zur "Sanger-Sequenzierung" (Los 2)

Description du marché

(1) Bei der Next Generation Sequencing (NGS) sind folgende Schlüsselkomponente erforderlich: a) Sequenzierung des gesamten Genoms (WGS): Bei dieser Dienstleistung wird das gesamte Genom eines Organismus sequenziert, um ein vollständiges Bild seines genetischen Aufbaus zu erhalten. Sie ist entscheidend für die Identifizierung von genetischen Variationen und Mutationen, die zu Krankheiten oder anderen Merkmalen beitragen können. b) RNA-Sequenzierung (RNA-Seq.): Mit dieser Methode wird die RNA in einer Probe sequenziert, so dass wir die Genexpression und -regulation untersuchen können. RNA-Seq. ist wichtig, um zu verstehen, wie Gene unter verschiedenen Bedingungen oder in verschiedenen Entwicklungsstadien an- und abgeschaltet werden. c) Gezielte Sequenzierung: Bei dieser Dienstleistung werden bestimmte Regionen des Genoms sequenziert, die von besonderem Interesse sind. Dies ist eine kostengünstige Möglichkeit, unvollständige, aber nützliche genomische Informationen zu erhalten. d) Epigenetische Profilerstellung: Mit dieser Technik werden DNA-Veränderungen analysiert, die die Sequenz nicht verändern, aber die Genaktivität beeinflussen. Die epigenetische Profilerstellung hilft uns zu verstehen, wie Umweltfaktoren die Genexpression beeinflussen und zu Krankheiten beitragen können. e) Amplikon-Metagenomik: Dieser Ansatz konzentriert sich auf die Vervielfältigung und Sequenzierung spezifischer Genregionen (Amplikons), um die biologische Vielfalt und mikrobielle Gemeinschaften und ihre funktionellen Fähigkeiten in verschiedenen Ökosystemen zu analysieren. Die Amplikon-Metagenomik bietet Einblicke in die Zusammensetzung und Vielfalt von Tiergemeinschaften und erleichtert die ökologische und evolutionäre Forschung. (2) Bei der Sanger-Sequenzierung sind folgende Schlüsselkomponente erforderlich: a) Sequenzierung von einzel- oder doppelsträngiger DNA: Bei diesem Service wird die Sequenzierungsreaktion mit Farbstoff-Terminator-Chemie für einzelne Gene durchgeführt und ist ideal für kurze Fragmente oder spezifische Regionen. b) Sequenzierung von 96-Well-Platten: Dieser Service umfasst die Sequenzierung mehrerer Proben in 96-Well-Platten für größere Projekte, die auf ein einzelnes Gen abzielen. c) DNA-Extraktion: Isolierung von DNA aus verschiedenen Probentypen, einschließlich Blut, Gewebe oder Umweltproben. d) DNA-Aufreinigung: Aufreinigung der DNA, um sicherzustellen, dass sie von hoher Qualität und frei von Verunreinigungen ist. e) Entwurf und Synthese von maßgeschneiderten Primern: Dieser Dienst entwirft und synthetisiert spezifische Primer für Zielgene. f) Reinigung von PCR-Produkten: Aufreinigung von PCR-Produkten zur Entfernung von Primern, Nukleotiden und Enzymen vor der Sequenzierung. Einzelheiten finden sich hierzu in Anlage C02 Leistungsverzeichnis sowie B01 Leistungsbeschreibung

Pouvoir adjudicateur